Gramps Webin käyttäminen Y-DNA-analyysiin

Huomautus

Tämä ominaisuus vaatii Gramps Web API -version 3.3.0 tai uudemman ja Gramps Web -frontend-version 25.9.0 tai uudemman.

Gramps Webin Y-DNA-näkymä voi käyttää raakadataa Y-kromosomin yksittäisistä nukleotidipolymorfismeista (SNP) määrittääkseen henkilön todennäköisimmän Y-DNA-haplogruunun ja näyttää periytyneet esi-isät ihmisen Y-kromosomipuussa aikahaarukoineen.

Kuinka hankkia ja tallentaa Y-DNA SNP -data

Hankkiaksesi Y-DNA SNP -datan, sinun on suoritettava Y-DNA-testi geneettisen testauspalvelun kautta. Tulos esitetään mutaatioiden (SNP) joukkona, joista kukin on tunnistettu merkkijonolla (esim. R-BY44535) ja + tai - merkki, joka osoittaa, onko mutaatio läsnä vai poissa. Gramps Web odottaa kaikkien testattujen SNP:iden merkkijonoa muodossa SNP1+, SNP2-, SNP3+,..., joka tallennetaan henkilön mukautetun tyypin Y-DNA (kirjainten koko on merkityksellinen) attribuuttiin. Voit joko luoda tämän attribuutin manuaalisesti Gramps Webissä tai Gramps Desktopissa, tai siirtyä Y-DNA-näkymään Gramps Webissä ja napsauttaa sinistä "Lisää" -painiketta, valita henkilön, jolle tiedot lisätään, ja liittää SNP-merkkijono. Joka tapauksessa tiedot tallennetaan henkilön attribuuttina Gramps-tietokantaasi.

Katso alla ohjeet siitä, kuinka hankkia SNP-data eri testauspalveluista.

Kuinka se toimii

Kun henkilöllä on Y-DNA-attribuutti, joka sisältää SNP-datan, Gramps Web käyttää avointa lähdekoodia yclade Python-kirjastoa määrittääkseen henkilön todennäköisimmän sijainnin ihmisen Y-kromosomipuussa. Puu on luotu YFull -projektin toimesta kymmenien tuhansien Y-DNA-testien perusteella. Huomaa, että Gramps Web käyttää paikallista kopiota YFull-puusta, joten tietoja ei lähetetä kolmansille osapuolille.

Puu kuljetaan juuresta lehtiin, ja jokaisessa solmussa verrataan kyseiseen solmuun liittyviä SNP:itä henkilön positiivisesti ja negatiivisesti testattuihin SNP:ihin, ja asianmukaista haaraa seurataan.

Lopullinen tulos on kladien peräkkäisyys puun juuresta (Y-kromosomaalinen "Adam" Adam) kaikkein kehittyneimpään kladiin, joka on johdonmukainen henkilön SNP-datan kanssa. Jokaisella kladilla on arvioitu ikä, joka perustuu YFull-tietokannan näytteiden ikään, jotka kuuluvat kyseiseen kladiin.

Koska Y-kromosomit periytyvät isältä pojalle, tämä peräkkäisyys vastaa henkilön patrilineaarista esi-isyyttä.

Kuinka tulkita tuloksia

Tärkein tieto on henkilön todennäköisin haplogruunu, joka näkyy sivun yläosassa. Nimi on linkitetty vastaavalle sivulle YFull -verkkosivustolla, joka sisältää lisätietoja, kuten testattujen näytteiden alkuperämaan, jotka kuuluvat kyseiseen haplogruunuun.

Gramps Webissä näkyvässä patrilineaarisessa esi-isäpuussa testatun henkilön yläpuolella oleva laatikko on kaikkien testattujen näytteiden viimeisin yhteinen esi-isä (MRCA), jotka kuuluvat henkilön haplogruunuun. Tälle esi-isälle näytettävä päivämäärä on hänen arvioitu syntymäaikansa. Hänen yläpuolellaan oleva esi-isä on se esi-isä, jossa tämä haplogruunia määrittävä mutaatio ilmestyi ensimmäisen kerran.

Y-kromosomien hitaasta mutaatiovauhdista johtuen MRCA voi olla useita satoja vuosia menneisyydessä. Harvinaisille haplogruunoille (ts. haplogruunoille, joista vain harvoja ihmisiä on testattu tähän mennessä) se voi olla jopa tuhansia vuosia.

Ohjeet SNP-datan hankkimiseen testauspalveluista

YSEQ

Kun olet kirjautunut "Oma tili" -osioon, siirry kohtaan "Omat tulokset / Näytä alleelit" ja siirry sivun alaosaan. Tekstikenttä "Alleelilista tiivistetty" on lisätty erityisesti Gramps Webiä varten ja se on juuri oikeassa muodossa liitettäväksi Y-DNA-attribuuttiin.