Usando o Gramps Web para Análise de Y-DNA

Nota

Este recurso requer a versão 3.3.0 ou posterior da API do Gramps Web e a versão 25.9.0 ou posterior do frontend do Gramps Web.

A visualização de Y-DNA no Gramps Web pode usar dados brutos de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) do cromossomo Y para determinar o haplogrupo Y-DNA mais provável de uma pessoa e exibir os ancestrais derivados na árvore do cromossomo Y humano, juntamente com estimativas de tempo.

Como obter e armazenar os dados SNP de Y-DNA

Para obter os dados SNP de Y-DNA, você precisa realizar um teste de Y-DNA através de um serviço de testes genéticos. O resultado é representado como um conjunto de mutações (SNPs), cada uma identificada por uma string (por exemplo, R-BY44535) e um sinal + ou - indicando se a mutação está presente ou ausente. O Gramps Web espera a string de todos os SNPs testados no formato SNP1+, SNP2-, SNP3+,... para ser armazenada em um atributo de pessoa de tipo personalizado Y-DNA (sensível a maiúsculas e minúsculas). Você pode criar manualmente esse atributo no Gramps Web ou no Gramps Desktop, ou navegar até a visualização de Y-DNA no Gramps Web e clicar no botão azul "Adicionar", selecionar a pessoa para a qual adicionar os dados e colar a string SNP. Em qualquer caso, os dados serão armazenados como um atributo de pessoa em seu banco de dados Gramps.

Veja abaixo para instruções sobre como obter os dados SNP de vários serviços de teste.

Como funciona

Uma vez que uma pessoa tenha um atributo Y-DNA contendo os dados SNP, o Gramps Web usará a biblioteca Python de código aberto yclade para determinar a posição mais provável da pessoa na árvore do cromossomo Y humano. A árvore foi criada pelo projeto YFull com base em dezenas de milhares de testes de Y-DNA. Observe que o Gramps Web usa uma cópia local da árvore YFull, portanto, nenhum dado é enviado a terceiros.

A árvore é percorrida da raiz até as folhas, e em cada nó, os SNPs associados a esse nó são comparados aos SNPs testados positivamente e negativamente da pessoa, e o ramo apropriado é seguido.

O resultado final é uma sucessão de clados da raiz da árvore (o “Adão” cromossômico Y) até o clado mais derivado que é consistente com os dados SNP da pessoa. Cada clado tem uma idade estimada com base nas idades das amostras no banco de dados YFull que pertencem a esse clado.

Como os cromossomos Y são herdados de pai para filho, essa sucessão corresponde a um trecho da ancestralidade patrilinear da pessoa.

Como interpretar os resultados

A informação mais importante é o haplogrupo mais provável da pessoa, mostrado na parte superior da página. O nome está vinculado à página correspondente no site YFull, que contém mais informações, como o país de origem das amostras testadas pertencentes a esse haplogrupo.

Na árvore de ancestrais patrilineares mostrada no Gramps Web, a caixa diretamente acima da pessoa testada é o ancestral comum mais recente (MRCA) de todas as amostras testadas pertencentes ao haplogrupo da pessoa. A data mostrada para esse ancestral é sua data de nascimento aproximada estimada. O ancestral acima dele é o ancestral onde a mutação que define esse haplogrupo apareceu pela primeira vez.

Devido à lenta taxa de mutação dos cromossomos Y, o MRCA pode estar muitos centenas de anos no passado. Para haplogrupos raros (ou seja, haplogrupos onde poucas pessoas foram testadas até agora), pode até ser milhares de anos.

Instruções para obter dados SNP de serviços de teste

YSEQ

Uma vez logado em "Minha Conta", vá para "Meus Resultados / Ver meus Alelos" e navegue até o final da página. O campo de texto "Lista de alelos compacta" foi adicionado especificamente para o Gramps Web e está exatamente no formato certo para colar no atributo Y-DNA.